<div class="gmail_quote">Study of Mechanism and Effect (VDOSME-2012)<br>
<br>
DEADLINE EXTENDED to April 30th (Firm):<br>
ICBO 2012 workshop - Vaccine and Drug Ontology in the Study of Mechanism and<br>
Effect (VDOSME-2012)<br>
July 21st 2012, Graz, Austria<br>
<br>
SUBMISSION DEADLINE: April 30th 2012 *FIRM*<br>
<br>
Vaccines and drugs have contributed to dramatic improvements in public<br>
health worldwide. Over the last decade, there have been efforts in<br>
biomedical ontology that represent various areas associated with vaccines<br>
and drugs and which join existing health and clinical terminology systems<br>
(e.g., SNOMED, RxNorm, NDF-RT, and MedDRA) in their application to research<br>
and clinical data.<br>
<br>
The "Vaccine and Drug Ontology in the Study of Mechanism and Effect" (VDOSME<br>
2012) workshop will provide a platform for discussing problems and solutions<br>
in the development and application of biomedical ontologies to representing<br>
and analyzing vaccines/drugs, vaccine/drug administrations,<br>
vaccine/drug-induced immune responses, and similar topics. The workshop will<br>
cover:<br>
<br>
Ontology Coverage: Ontologies of vaccines, of drugs, and of studies thereof.<br>
Scope of Interest: Representations and analyses of vaccine and drug<br>
formation and preparation, administration, mechanisms, and effects based on<br>
such ontologies.<br>
<br>
Examples of biomedical subject matter in the scope of this workshop:<br>
vaccine/drug components (e.g., vaccine antigens, drug active ingredients,<br>
and adjuvants), administration details (e.g., dosage, administration route,<br>
and frequency), gene immune responses and pathways, drug-drug or drug-food<br>
interactions. We will also focus on computational methods used to study<br>
these, for example, literature mining of vaccine/drug-gene interaction<br>
networks, meta-analysis of host immune responses, and time event analysis of<br>
vaccine/drug effects.<br>
<br>
All workshop attendees will be expected, at the workshop, to present either<br>
descriptions of their work or to articulate a position. In addition a number<br>
of participants will be selected to lead interactive sessions on focused<br>
topics.<br>
<br>
*** Submission Guidelines ***<br>
Full papers must describe novel ontology-related research, not previously<br>
been published and not submitted to other conferences. Short papers describe<br>
research results which are more preliminary or communicate brief position<br>
statements. We also invite full length application-oriented papers, to<br>
showcase the development of novel and successful applications utilizing<br>
ontologies and knowledge-based technologies.<br>
<br>
The maximum allowed page lengths of contributions are as follows.<br>
<br>
Full paper submission: 5 pages, due Apr 30 (Firm), 2012<br>
Short paper submission: 3 pages, due Apr 30 (Firm), 2012<br>
Statement of interest: 1-2 pages, due Apr 30 (Firm), 2012<br>
<br>
*** Journal Publication ***<br>
All full-length papers accepted in this workshop will be invited to extend<br>
the workshop papers and be included in a special issue in the Joural of<br>
Biomedical Semantics. We believe that the eventual inclusion of accepted<br>
full-length publication in the special issue will stimulate more submissions<br>
of high quality manuscripts.<br>
<br>
*** Contact ***<br>
If you have any question or which to enquire about the workshop, please<br>
contact us at <a href="mailto:organizers-vdosme2012@googlegroups.com">organizers-vdosme2012@googlegroups.com</a>.<br>
<br>
*** Chairs ***<br>
Yongqun łOliver˛ He, University of Michigan<br>
Luca Toldo, Merck KGaA<br>
Gully Burns, Information Sciences Institute<br>
Cui Tao, Mayo Clinic<br>
Darrell R. Abernethy, U.S. Food and Drug Administration (FDA)<br>
<br>
*** Program committee (PC) Members ***<br>
Richard Boyce, University of Pittsburgh<br>
Lindsay Cowell, University of Texas Southwestern Medical Center<br>
Dingcheng Li, Mayo Clinic<br>
Asiyah Yu Lin, University of Michigan<br>
Bjoen Peters, La Jolla Institute for Allergy and Immunology<br>
Sira Sarntivijai, University of Michigan/US FDA<br>
Nigam Shah, Stanford University<br>
Sunghwan Sohn, Mayo Clinic<br>
Larisa Soldatova, Aberystwyth University<br>
Stephen Wu, Mayo Clinic<br>
Qian Zhu, Mayo Clinic<br>
<br>
More information is available at:<br>
<a href="http://kr-med.org/icbofois2012/vdosme/submission.htm" target="_blank">http://kr-med.org/icbofois2012/vdosme/submission.htm</a><br>
<br>
A related workshop in ICBO 2012:<br>
Workshop Name: Methods for adverse events representation Ontology and<br>
Information Model<br>
URL: <a href="http://kr-med.org/icbofois2012/adverse_events/" target="_blank">http://kr-med.org/icbofois2012/adverse_events/</a><br>
<br>
Oliver<br>
<br>
Yongqun "Oliver" He, DVM, PhD<br>
Associate Professor<br>
Unit for Laboratory Animal Medicine<br>
Department of Microbiology and Immunology<br>
and Center for Computational Medicine and Bioinformatics<br>
University of Michigan Medical School<br>
Ann Arbor, MI 48109<br>
Email: <a href="mailto:yongqunh@med.umich.edu">yongqunh@med.umich.edu</a><br>
Tel: <a href="tel:734-615-8231" value="+17346158231">734-615-8231</a> (O)<br>
<a href="http://www.hegroup.org/" target="_blank">http://www.hegroup.org/</a><br>
<br>
<br>
<br>
**********************************************************<br>
Electronic Mail is not secure, may not be read every day, and should not be<br>
used for urgent or sensitive issues<br>
<br>
<br>
----------------------------------------------------------------------------<br>
--<br>
For Developers, A Lot Can Happen In A Second.<br>
Boundary is the first to Know...and Tell You.<br>
Monitor Your Applications in Ultra-Fine Resolution. Try it FREE!<br>
<a href="http://p.sf.net/sfu/Boundary-d2dvs2" target="_blank">http://p.sf.net/sfu/Boundary-d2dvs2</a><br>
_______________________________________________<br>
Oae-devel mailing list<br>
<a href="mailto:Oae-devel@lists.sourceforge.net">Oae-devel@lists.sourceforge.net</a><br>
<a href="https://lists.sourceforge.net/lists/listinfo/oae-devel" target="_blank">https://lists.sourceforge.net/lists/listinfo/oae-devel</a><br>
<br>
------ End of Forwarded Message<br>
<br>
<br>
------ End of Forwarded Message<br>
<br>
</div><br>