
<html>

<head>

<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=iso-8859-1">

</head>

<body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; ">

<div>We are pleased to announce that selected papers from the BioNLP Shared Task 2011 have been published as a special issue in BMC Bioinformatics:</div>

<div><br>

<blockquote type="cite">

<div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; ">

<div><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; font-family: Helvetica; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-align: -webkit-auto; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; font-size: medium; "><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; font-family: Helvetica; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-align: -webkit-auto; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; font-size: medium; "><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; font-family: Helvetica; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-align: -webkit-auto; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; font-size: medium; ">

<div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; ">

<span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; font-family: Helvetica; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-align: -webkit-auto; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; font-size: medium; ">

<div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; ">

<div>

<div></div>

</div>

</div>

</span></div>

</span></span></span></div>

</div>

</blockquote>

<div>

<div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; ">

<div><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; font-family: Helvetica; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-align: -webkit-auto; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; font-size: medium; "><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; font-family: Helvetica; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-align: -webkit-auto; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; font-size: medium; "><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; font-family: Helvetica; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-align: -webkit-auto; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; font-size: medium; ">

<div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; ">

<span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; font-family: Helvetica; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-align: -webkit-auto; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; font-size: medium; ">

<div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; ">

<div>

<div><a href="http://www.biomedcentral.com/bmcbioinformatics/supplements/13/S11">BMC Bioinformatics Volume 13 Supplement 11"Selected articles from the BioNLP Shared Task 2011"</a></div>

<div>

<div>

<div>Edited by Jin-Dong Kim, Sampo Pyysalo, Claire Nédellec, Sophia Ananiadou and Jun'ichi Tsujii</div>

</div>

</div>

<div><br>

</div>

<div>Papers in the special issue</div>

<div>------------------------------------<br>

<div><br>

<a href="http://www.biomedcentral.com/1471-2105/13/S11/S1">The Genia Event and Protein Coreference tasks of the BioNLP Shared Task 2011</a><br>

Jin-Dong Kim, Ngan Nguyen, Yue Wang, Jun'ichi Tsujii, Toshihisa Takagi, Akinori Yonezawa<br>

<br>

<a href="http://www.biomedcentral.com/1471-2105/13/S11/S2">Overview of the ID, EPI and REL tasks of BioNLP Shared Task 2011</a><br>

Sampo Pyysalo, Tomoko Ohta, Rafal Rak, Dan Sullivan, Chunhong Mao, Chunxia Wang, Bruno Sobral, Jun'ichi Tsujii, Sophia Ananiadou<br>

<br>

<a href="http://www.biomedcentral.com/1471-2105/13/S11/S3">BioNLP Shared Task - The Bacteria Track</a><br>

Robert Bossy, Julien Jourde, Alain-Pierre Manine, Philippe Veber, Erick Alphonse, Maarten van de Guchte, Philippe Bessières, Claire Nédellec<br>

<br>

<a href="http://www.biomedcentral.com/1471-2105/13/S11/S4">University of Turku in the BioNLP'11 Shared Task</a><br>

Jari Björne, Filip Ginter, Tapio Salakoski<br>

<br>

<a href="http://www.biomedcentral.com/1471-2105/13/S11/S5">Biomedical event extraction from abstracts and full papers using search-based structured prediction</a><br>

Andreas Vlachos, Mark Craven<br>

<br>

<a href="http://www.biomedcentral.com/1471-2105/13/S11/S6">Semantically linking molecular entities in literature through entity relationships</a><br>

Sofie Van Landeghem, Jari Björne, Thomas Abeel, Bernard De Baets, Tapio Salakoski, Yves Van de Peer<br>

<br>

<a href="http://www.biomedcentral.com/1471-2105/13/S11/S7">Biological event composition</a><br>

Halil Kilicoglu, Sabine Bergler<br>

<br>

<a href="http://www.biomedcentral.com/1471-2105/13/S11/S8">Event extraction of bacteria biotopes: a knowledge-intensive NLP-based approach</a><br>

Zorana Ratkovic, Wiktoria Golik, Pierre Warnier<br>

<br>

<a href="http://www.biomedcentral.com/1471-2105/13/S11/S9">Combining joint models for biomedical event extraction</a><br>

David McClosky, Sebastian Riedel, Mihai Surdeanu, Andrew McCallum, Christopher D Manning</div>

</div>

--------</div>

<div><br>

</div>

<div>Paul Thompson<br>

Research Associate<br>

School of Computer Science<br>

National Centre for Text Mining<br>

Manchester Institute of Biotechnology<br>

University of Manchester<br>

131 Princess Street<br>

Manchester<br>

M1 7DN<br>

UK<br>

Tel: 0161 306 3091<br>

<a href="http://personalpages.manchester.ac.uk/staff/Paul.Thompson/">http://personalpages.manchester.ac.uk/staff/Paul.Thompson/</a></div>

<div><br>

</div>

</div>

</span></div>

</span><br>

</span></span></div>

</div>

</div>

</div>

</body>

</html>