<div dir="ltr"><div><div>CALL FOR PAPERS / PARTICIPATION -- <span>CLEF</span>-<span>ER</span> 2013 Workshop (<span>CLEF</span> Conference) Valencia, 23-26 Sep 2013<br>

<span>CLEF</span>-<span>ER</span> 2013: Named Entity Recognition (<span style="background:none repeat scroll 0% 0% yellow"><span><span><span style="background:none repeat scroll 0% 0% yellow">NER</span></span></span></span>) in parallel multilingual biomedical corpora (aiming for terminology translation)<br>

</div><br><br>CALL FOR PAPERS<br>-- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --<br>We are interested in papers describing challenge systems or related research and position papers, tackling questions like:<br>- Can we build multilingual biomedical terminologies from parallel biomedical corpora?<br>

- How do we exploit machine translation methods to identify correspondences in parallel corpora?<br>

- Do we encounter the same semantic representation in different languages?<br>

- Can we make use of crowd-sourcing solutions to produce comprehensive terminological resources?<br></div>Please submit us an extended abstract (normally 2 pages) via <span><span style="background:none repeat scroll 0% 0% yellow">EasyChair</span></span>: <a href="https://www" target="_blank">https://www</a>.<span><span style="background:none repeat scroll 0% 0% yellow">easychair</span></span>.org/<div dir="ltr">

conferences/?<span><span style="background:none repeat scroll 0% 0% yellow">conf</span></span>=clefer2013 <br>

Accepted abstracts will become part of the CLEF proceedings. The best 

contribution wins a prize, which is the waiving of publication costs in 

an open access journal!<br>

<div><div><br><br>CALL FOR CHALLENGE PARTICIPATION<br>

-- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --<br>

Objectives:<br>

Multilingual identification of mentions of named entities (attribution of <span><span><span style="background:none repeat scroll 0% 0% yellow">CUIs</span></span></span>) in corpora, where each corpus is either in English, French,<br>

German, Spanish, and Dutch.  Currently patent texts, titles of <span><span><span style="background:none repeat scroll 0% 0% yellow">Medline</span></span></span> abstracts and <span><span><span style="background:none repeat scroll 0% 0% yellow">EMEA</span></span></span>

 documents serve as parallel corpora.   The mention annotations will be 

evaluated as part of the challenge and, in addition, the mention 

annotations will be analysed to contribute to an augmented biomedical 

terminological resource.<br>

<br>

Task:<br>

Participants produce mention annotations in a multilingual document 

where the annotations make explicit reference to entities, which are 

specified through a Concept Unique Identifier (<span style="background:none repeat scroll 0% 0% yellow">CUI, from the <span style="background:none repeat scroll 0% 0% yellow">UMLS).

 Challenge participants should at least contribute one non-English 

annotated corpus and have to register at the submission site (<a href="http://www.clefer.org/access-content" target="_blank">http://www.<span><span><span><span style="background:none repeat scroll 0% 0% yellow">clefer</span></span></span></span>.org/access-content</a>).<br>

<br>

A number of resources are available too:<br>

(1) a terminological resource (TR) containing English and non-English concepts in combination with their <span><span><span style="background:none repeat scroll 0% 0% yellow">CUIs</span></span></span>,<br>

(2) a selection of corpora in English, where the entity mentions have been annotated automatically with their <span><span><span style="background:none repeat scroll 0% 0% yellow">CUIs</span></span></span>, and<br>

(3) a selection of corpora in different languages other than English (i.e., <span><span><span style="background:none repeat scroll 0% 0% yellow">de</span></span></span>, fr, <span><span><span style="background:none repeat scroll 0% 0% yellow">sp</span></span></span>, <span><span><span style="background:none repeat scroll 0% 0% yellow">nl</span></span></span>) that have to be annotated with entity mentions and their <span><span><span style="background:none repeat scroll 0% 0% yellow">CUIs</span></span></span>.<br>

<br>

Note:<br>

Each non-English corpus has a parallel English corpus. Not all languages (<span><span><span style="background:none repeat scroll 0% 0% yellow">de</span></span></span>, fr, <span><span><span style="background:none repeat scroll 0% 0% yellow">sp</span></span></span>, <span><span><span style="background:none repeat scroll 0% 0% yellow">nl</span></span></span>)

 are available for each corpus.  Parallel corpora offer the opportunity 

to use machine-translation or bilingual term identification methods. The

 results will be presented on the <span>CLEF</span>-<span>ER</span> workshop, which is part of the <span>CLEF</span>

 2013 Conference, 23-26 September in Valencia, Spain. The challenge is 

sponsored by the EU project “Mantra”. For more details on the task 

please visit <a href="http://www.clefer.org/" target="_blank">http://www.<span><span><span><span style="background:none repeat scroll 0% 0% yellow">clefer</span></span></span></span>.org/</a> or send an email to<a href="mailto:challenge@clefer.org" target="_blank"> challenge@<span><span><span><span style="background:none repeat scroll 0% 0% yellow">clefer</span></span></span></span>.org</a><br>

<br><br>TIME and PLACE<br>

-- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --<br>

<span>CLEF</span> 2013 Conference, 23-26 September in Valencia, Spain.<br>

<br>

<br>

TIMELINE<br>

-- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --<br>

* 15-May : submission of extended abstracts ends, submission system for challenge closes</div><div>

* 31-May : review results & preliminary evaluation results released<br>

* 15-Jun: submission of the final paper to the <span>CLEF</span> organisers<br></div><div>* 23-Sep: <span>CLEF</span> 2013 conference starts<br></div><div>* 26-Sep: CLEF 2013 ends<br></div><div>

<br><br>

ORGANIZERS<br>

-- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --<br>

* D. <span style="background:none repeat scroll 0% 0% yellow"><span><span><span style="background:none repeat scroll 0% 0% yellow">Rebholz</span></span></span></span>-<span style="background:none repeat scroll 0% 0% yellow"><span><span><span style="background:none repeat scroll 0% 0% yellow">Schuhmann</span></span></span></span>, F. <span style="background:none repeat scroll 0% 0% yellow"><span><span><span style="background:none repeat scroll 0% 0% yellow">Rinaldi</span></span></span></span>, S. <span style="background:none repeat scroll 0% 0% yellow"><span><span><span style="background:none repeat scroll 0% 0% yellow">Clematide</span></span></span></span>, Institute of<br>

Computational Linguistics, <span style="background:none repeat scroll 0% 0% yellow"><span><span><span style="background:none repeat scroll 0% 0% yellow">Universität</span></span></span></span> <span style="background:none repeat scroll 0% 0% yellow"><span><span><span style="background:none repeat scroll 0% 0% yellow">Zürich</span></span></span></span> (Ch)<br>

* Prof. U. Hahn, J. <span style="background:none repeat scroll 0% 0% yellow"><span><span><span style="background:none repeat scroll 0% 0% yellow">Hellrich</span></span></span></span>, Julie Laboratory, <span style="background:none repeat scroll 0% 0% yellow"><span><span><span style="background:none repeat scroll 0% 0% yellow">Universität</span></span></span></span> Jena (D)<br>

* J. <span style="background:none repeat scroll 0% 0% yellow"><span><span><span style="background:none repeat scroll 0% 0% yellow">Kors</span></span></span></span>, E. van <span style="background:none repeat scroll 0% 0% yellow"><span><span><span style="background:none repeat scroll 0% 0% yellow">Mulligen</span></span></span></span>, Erasmus University Medical Center, Rotterdam (<span style="background:none repeat scroll 0% 0% yellow"><span><span><span style="background:none repeat scroll 0% 0% yellow">Nl</span></span></span></span>)<br>

* D. <span style="background:none repeat scroll 0% 0% yellow"><span><span><span style="background:none repeat scroll 0% 0% yellow">Milward</span></span></span></span>, I. <span style="background:none repeat scroll 0% 0% yellow"><span><span><span style="background:none repeat scroll 0% 0% yellow">Lewin</span></span></span></span>, <span style="background:none repeat scroll 0% 0% yellow"><span><span><span style="background:none repeat scroll 0% 0% yellow">Linguamatics</span></span></span></span> Ltd, Cambridge (UK)<br>

* P. <span style="background:none repeat scroll 0% 0% yellow"><span><span><span style="background:none repeat scroll 0% 0% yellow">Daumke</span></span></span></span>, M. <span style="background:none repeat scroll 0% 0% yellow"><span><span><span style="background:none repeat scroll 0% 0% yellow">Poprat</span></span></span></span>, <span style="background:none repeat scroll 0% 0% yellow"><span><span><span style="background:none repeat scroll 0% 0% yellow">Averbis</span></span></span></span> <span style="background:none repeat scroll 0% 0% yellow"><span><span><span style="background:none repeat scroll 0% 0% yellow">GmbH</span></span></span></span>, <span style="background:none repeat scroll 0% 0% yellow"><span><span><span style="background:none repeat scroll 0% 0% yellow">Freiburg</span></span></span></span> (D)<br>

* J. <span style="background:none repeat scroll 0% 0% yellow"><span><span><span style="background:none repeat scroll 0% 0% yellow">McEntyre</span></span></span></span>, S. <span style="background:none repeat scroll 0% 0% yellow"><span><span><span style="background:none repeat scroll 0% 0% yellow">Kafkas</span></span></span></span>, <span style="background:none repeat scroll 0% 0% yellow"><span><span><span style="background:none repeat scroll 0% 0% yellow">EMBL</span></span></span></span>-<span style="background:none repeat scroll 0% 0% yellow"><span><span><span style="background:none repeat scroll 0% 0% yellow">EBI</span></span></span></span>, <span style="background:none repeat scroll 0% 0% yellow"><span><span><span style="background:none repeat scroll 0% 0% yellow">Hinxton</span></span></span></span>, Cambridge, U.K</div>

</div></div></div>