
<head></head><body><div> Except that in many cases regulatory genes a) CHANGE their chemical modification as cell types proliferate, and b) regulatory sequences themselves sometimes move around as the body develops and cell types proliferate. Also there are changes in the PROTEOME, the totality of proteins that does the actual regulatory work of maintaining and modifying DNA and the RNA that is transcribed from it- proteins can be chemically modified by addition or subtraction of bits and pieces after creation.. Add to this modifications made to the RNA (variable editing of long sequences to produce many different shorter ones for translation to protein, as well as chemical modification of the bases in the RNA sequences that change their interactions with other molecules, and T-RNA's which mediate translation from the messenger RNA code to protein can also be modified).<br><br>The point is that EVERYTHING is in flux- the DNA regulatory sequences, messenger and T-RNA's, and the proteome itself. The only thing that doesn't really move around in a lifetime is normal coding DNA- but even this does change quite a bit over multiple generations- you can have loss, creation, duplication, additions, deletions, inversions, movements to different places in the chromosome, etc. A bit like a lexicon. All the other stuff is more like the grammar (including pragmatics- most of the higher level regulatory changes are context-dependent). And grammar changes much faster than lexicon. Regulatory linkages change radically over evolutionary time, which is what allow us to be us and not slime molds. And like the core lexicon, there is a set of life-vital codes that have not changed much for billions of years (like the histone proteins that allow DNA to wind up into more compact forms).<br><br>BTW, there is quite a bit of parallelism between genetic and linguistic typology in some areas- for instance morphosyntax type (isolating/analytical, agglutinative, synthetic/inflective, polysynthetic) versus the split genes in eukaryotic cells, the appositional genes in bacteria, and overlapping genes in many viruses. The list of parallels goes on, not that it is particularly relevent to this thread, but I thought it might be an interesting diversion.<br><br>Jess Tauber<br>phonosemantics@earthlink.net<br></div></body>