Job: Post-doc de 6 mois, Annotation semantique d'information textuelle en biologie vegetale

[Thierry Hamon]

Date: Wed, 25 Jun 2014 09:52:57 +0200
From: Claire Nedellec <claire.nedellec at jouy.inra.fr>
Message-ID: <53AA7FD9.9000104 at jouy.inra.fr>
X-url: http://genome.jouy.inra.fr/bibliome/
X-url: http://www.campus-paris-saclay.fr/index.php/en/Idex-Paris-Saclay/Les-Lidex/Paris-Saclay-Center-for-Data-Science
X-url: https://sites.google.com/site/bionlpst2013/


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Post-doc ou ingénieur, 6 mois en annotation sémantique de textes
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L’équipe Bibliome de l’unité MIG (INRA) recherche un post-doctorant ou
ingénieur à temps plein pour une durée de 6 mois sur l’annotation
manuelle et automatique d’articles scientifiques de biologie guidée par
un modèle de connaissance dans le cadre du projet DataChallenge conjoint
MIG et LIMSI (CNRS). Il est financé par le Center for Data Science (Idex
Paris-Saclay).

La personne engagée coordonnera la finalisation de l’annotation manuelle
d’articles de biologie moléculaire par des experts biologistes en vue de
la préparation d'une tâche pour un challenge d’extraction automatique
d’information à partir de textes. Le domaine concerné est le
développement de la graine chez l'arabette (Arabidopsis thaliana). Le
modèle de connaissances qui est utilisé pour l'annotation devra être
comparé à d'autres modèles proposés pour d’autres espèces (humain,
procaryotes). Un modèle unifié pourra être proposé pour la
représentation des connaissances du texte qui soit approprié à son
utilisation en Biologie des Systèmes.

Compétences: extraction d’information, annotation manuelle de texte,
ingénierie de la connaissance, biologie moléculaire.

Candidature : envoi du CV et de publications par email.
Contact : Claire Nédellec (claire.nedellec at jouy.inra.fr) et Robert Bossy
(robert.bossy at jouy.inra.fr)

Lieu de travail : Unité MIG, centre de recherche INRA de Jouy-en-Josas.
Date : A partir juillet 2014
Rémunération : grille de salaire INRA
Références:
    Bibliome: http://genome.jouy.inra.fr/bibliome/
    CDS:
    http://www.campus-paris-saclay.fr/index.php/en/Idex-Paris-Saclay/Les-Lidex/Paris-Saclay-Center-for-Data-Science
    BioNLP-ST 2013 (tasks GE & GRN):
    https://sites.google.com/site/bionlpst2013/

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